Em 2000, foi anunciado a saída de Luiz Henrique Júnior, ex-assessor do então secretário de Estado Luiz Henrique Magalhães.
Em 11 5️⃣ de janeiro do mesmo ano, no entanto, João Mendes foi anunciado como novo ministro da Defesa Nacional, substituindo Eduardo Cunha 5️⃣ Lima, o ministro responsável para o caso.
Já o titular da função durante o período do ministério seria Rodrigo Janot.
Em 17 5️⃣ de janeiro de 2000, o presidente Itamar Franco foi demitido do Ministério da Defesa Nacional, por um decreto presidencial, e 5️⃣ substituído pelo marechal Álvaro Costa.
Ele também foi substituído por
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