Atualmente joga no Alianza Lima.
No dia 17 de janeiro de 2012, o Palmeiras anunciou oficialmente a contratação de Barcos.
O clube 3️⃣ brasileiro acertou a compra de 70% dos direitos econômicos do atacante por um valor de US$ 3,5 milhões (R$ 6,24 3️⃣ milhões).[1][2]
No dia 8 de fevereiro de 2012, o jogador fez casa de apostas verde estreia pelo Palmeiras, jogando os quinze minutos finais da 3️⃣ partida.
Hernán Barcos não marcou gols, mas o Palmeiras venceu o XV de Piracicaba por 3 a 2.
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